Un biolaveur est généralement constitué d'un compartiment de lavage et d'un compartiment de régénération.
Dans la zone d'épuration, qui peut être une colonne de pulvérisation dans laquelle des gouttelettes d'eau finement distribuées s'écoulent à contre-courant avec le gaz résiduaire, il y a un transfert de masse continu de polluants et d'oxygène du gaz résiduaire vers la phase liquide.
Le taux de transfert de masse d'un composé donné est déterminé par le produit des coefficients de transfert globaux, de la surface de contact totale dans la colonne et de la force d'entraînement moyenne.
Par conséquent, l'absorption d'un composé sera plus élevée si sa concentration dans l'eau de lavage est faible et sa solubilité dans l'eau plus élevée. Les substances absorbées dans l'eau seront oxydées par l'activité microbienne et éliminées de la phase liquide par une suspension de boues activées dans un compartiment de régénération.
Le mélange, soit par agitation, soit par aération, sera nécessaire pour empêcher la sédimentation de la suspension de boue microbienne.
Les conditions physiques et chimiques telles que la température, le pH, le rapport du carbone à l'azote et au phosphore doivent être ajustées pour assurer une oxydation microbienne optimale.